Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ssh3Q8K330 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ssh3Q8K330 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms