Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prpf39Q8K2Z2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Prpf39Q8K2Z2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms