Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stn1Q8K2X3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stn1Q8K2X3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms