Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Depp1Q8K2F3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Depp1Q8K2F3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms