Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brd3Q8K2F0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Brd3Q8K2F0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms