Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mtmr3Q8K296 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mtmr3Q8K296 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms