Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prkd3Q8K1Y2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms