Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nek9Q8K1R7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek9Q8K1R7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms