Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pnma3Q8JZW8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pnma3Q8JZW8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms