Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brf1Q8CFK2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brf1Q8CFK2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms