Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp27Q8CEG8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Usp27Q8CEG8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Usp27Q8CEG8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp27Q8CEG8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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