Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc17Q8CE13 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc17Q8CE13 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc17Q8CE13 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms