Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc178Q8CDV0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc178Q8CDV0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc178Q8CDV0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms