Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riox2Q8CD15 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms