Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ufl1Q8CCJ3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ufl1Q8CCJ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms