Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrip1Q8CBD1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrip1Q8CBD1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms