Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrn3Q8CBC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrrn3Q8CBC6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms