Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BC049762Q8C601 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BC049762Q8C601 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms