Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cwc22Q8C5N3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cwc22Q8C5N3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms