Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0E3

Trim47, Tripartite motif-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim47Q8C0E3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim47Q8C0E3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim47Q8C0E3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim47Q8C0E3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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