Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp47Q8BY87 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Usp47Q8BY87 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Usp47Q8BY87 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms