Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn17Q8BXA6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms