Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rbbp5Q8BX09 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rbbp5Q8BX09 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms