Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp38Q8BW70 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp38Q8BW70 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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