Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Catsper4Q8BVN3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Catsper4Q8BVN3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms