Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmod1Q8BVA4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lmod1Q8BVA4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lmod1Q8BVA4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms