Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PcgF3Q8BTQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PcgF3Q8BTQ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms