Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps6kb1Q8BSK8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms