Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms