Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF3

Me3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me3Q8BMF3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Me3Q8BMF3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me3Q8BMF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms