Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Usp54Q8BL06 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Usp54Q8BL06 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp54Q8BL06 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms