Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms