Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tspan9Q8BJU2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tspan9Q8BJU2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181 ms