Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rufy1Q8BIJ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms