Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Best2Q8BGM5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Best2Q8BGM5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Best2Q8BGM5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms