Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2af1l4Q8BGJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2af1l4Q8BGJ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms