Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Srgap3Q812A2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Srgap3Q812A2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Srgap3Q812A2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms