Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Cdc42bpbQ7TT50 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cdc42bpbQ7TT50 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cdc42bpbQ7TT50 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cdc42bpbQ7TT50 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms