Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccp110Q7TSH4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccp110Q7TSH4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms