Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Dsg1bQ7TSF1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Dsg1bQ7TSF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Dsg1bQ7TSF1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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