Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSA6

Proser3, Proline and serine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Proser3Q7TSA6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Proser3Q7TSA6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Proser3Q7TSA6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Proser3Q7TSA6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms