Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim17Q7TPM3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trim17Q7TPM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trim17Q7TPM3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms