Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim12Q78RX3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim12Q78RX3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms