Protein–RNA interactions for Protein: Q78IK2

Usmg5, Up-regulated during skeletal muscle growth protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usmg5Q78IK2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Usmg5Q78IK2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Usmg5Q78IK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usmg5Q78IK2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms