Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ncapd3Q6ZQK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ncapd3Q6ZQK0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ncapd3Q6ZQK0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms