Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nup188Q6ZQH8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nup188Q6ZQH8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms