Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Igsf3Q6ZQA6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igsf3Q6ZQA6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms