Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
March6Q6ZQ89 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
March6Q6ZQ89 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms