Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rhox8Q6VSS7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rhox8Q6VSS7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rhox8Q6VSS7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rhox8Q6VSS7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms