Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ift172Q6VH22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ift172Q6VH22 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ift172Q6VH22 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms